Por orden del abad Abbone, y mientras la muerte sigue trastornando la vida de la abadía, William les pide a los monjes que intenten arrojar luz sobre los hechos y todos los rastros conducen directamente a la biblioteca, una especie de laberinto inaccesible del cual solo el El bibliotecario conoce los secretos. Mientras tanto, el brutal inquisidor Bernardo Gui, dirigido a la abadía con su escolta armada, realiza una sangrienta masacre en un refugio de los herejes Dolciniani, exterminando a la familia de Anna, hija de Dolcino y Margherita.